肚脐眼正中疼痛可能有以下几种原因：1、炎症、感染：肚脐容易沉积脏东西，如果肚脐周围有炎症以及感染时可能会有疼痛；2、疝：观察肚脐是否凸出，以及鼓出东西，如脐疝。肚脐是薄弱区，肠子可能有内容物，大网膜、小肠可能经过，并鼓出小包，反复疝可能会引起肚脐疼痛；3、肿瘤：如直肠癌、乙状结肠癌、膀胱癌、前列腺癌、子宫内膜癌、卵巢癌，恶性肿瘤可能会转移到肚脐，造成转移瘤引起疼痛，有时伴有出血。无论是哪种情况，出现肚脐疼痛时应该及时就诊，可以就诊疝与腹壁外科、结直肠外科，或者胃肠外科，进行体格检查，必要时可以做腹部彩超或CT，判断有无上述原因。