小便时有时会肚脐眼(即肚脐)特别痛，可能有以下原因：1、膀胱痉挛或肠痉挛：患者在排小便的过程中需要用腹压，这样可以促进排尿，使用腹压时，患者就可能出现肠痉挛，肠痉挛后可能表现为肚脐部位有疼痛。如果有膀胱炎、尿道炎，患者排尿的过程中，膀胱会收缩，这种情况在膀胱区也会出现疼痛，很多患者感觉是肚脐部位有疼痛；2、前列腺炎：男性患者在排小便过程中，可能会出现腰骶部、腹股沟区、耻骨上、肚脐部位的疼痛；3、盆腔炎：由于盆腔有炎症，盆腔内有渗液，就可能刺激腹膜，导致女性患者肚脐部位有疼痛。患者排小便时肚脐部位有疼痛，要及时做尿常规检查、血常规检查、腹部B超检查等，做出有效评估。