药物流产与人工流产的区别以及危害主要有以下几点：1、方式不同：药物流产采用服用药物的方法来终止妊娠，而人工流产采用手术方式来终止妊娠；2、适宜人群不同：药物流产主要针对停经49天以内，超声下胎囊直径＜2cm的早期妊娠女性，而人工流产主要针对停经10周，也就是70天以内的妊娠状态来进行手术操作，所以人工流产比药物流产的适用时间范围更加宽泛；3、成功率不同：药物流产的成功率大约在80%-90%，人工流产成功率则更高；4、对子宫损伤不同：药物流产如果成功，对子宫损伤比人工流产要小，因为人工流产是一种手术操作，对子宫内膜损伤相对较大。具体选择药物流产还是人工流产，要根据女性怀孕时间、胎囊大小来决定。另外还要根据病人是否有药物禁忌症和过敏史进行判断，采用药物流产有一定失败率，需要进行随访观察。如果药物流产失败，还需要再进行清宫手术来进行宫腔搔刮，才能使胚胎排干净。