根治幽门螺杆菌的用药，主要是四联治疗、两周方案，可使用的药物如下：1、质子泵抑制剂：奥美拉唑、雷贝拉唑、艾普拉唑、泮托拉唑等，一般对于初治的病人，选择哪一种药物都可以。但是如果对于曾经治疗过，且治疗失败的病人，可能会更加推荐使用雷贝拉唑类药物；2、铋剂：临床上用得比较多的有复合的含钾的铋剂，如复方铝酸铋颗粒以及胶体果胶铋制剂；3、抗生素：需要从阿莫西林、左氧氟沙星、克拉霉素、甲硝唑、替硝唑、米诺环素、呋喃唑酮等抗生素中，选择两种抗生素，然后与选择的质子泵抑制剂、铋剂组成经典的四联、两周杀灭幽门螺杆菌的方案。对于抗生素的选择，一般如果病人没有青霉素过敏史，首选阿莫西林，在此前提下，会搭配如米诺环素、克拉霉素组成四联的根治幽门螺杆菌的方案。此种方案总的有效率，对于大部分病人能达到90%以上。如果对青霉素过敏，可以用左氧氟沙星代替阿莫西林，也能够达到比较好的疗效。对于特殊病人，即如果反反复复治疗幽门螺杆菌效果不好，需要做胃镜。在胃镜下取病理以后，在体外做耐药试验，筛查病人适合用什么样的药物。然后在药敏试验的指导下，进行杀幽门螺杆菌治疗，就能够达到根治幽门螺杆菌的目的。