当转动肩膀时发出咯咯响，可以采取以下几种方法进行处理：

1. 锻炼三角肌以及肩袖肌肉：可以通过抗阻力训练来增强肩关节稳定性，如使用哑铃或壶铃，从而让肩关节活动时异响消失。
2. 针对肩周炎进行治疗：如果是因为肩周炎导致的症状，可以采取手法按摩配合肩关节功能锻炼进行治疗。按摩可以促进局部的血液循环，加速炎症渗出物的吸收，促进肩关节功能的恢复。如果病情较重，可以在医生的指导下应用药物进行治疗。
3. 针对肩峰撞击综合征进行治疗：如果是由于上臂上举后肩袖受到肩峰和肱骨大结节的撞击造成的，病情较轻时，可以使用三角巾或者吊带进行制动，有利于肩膀局部组织进行恢复。在医生的指导下应用药物进行缓解治疗，若症状未得到改善，还可以在医生的指导下进行关节功能康复锻炼，促进关节的恢复。
4. 其他原因：如果是因为肌肉劳损、肌腱滑脱、暴力撞击所引起或者剧烈运动所导致的暂时性不适应，一般通过休息和适当按摩就能缓解症状。

总之，当转动肩膀时出现咯咯响的情况，一定要查明原因，并根据具体病情采取相应的治疗方法。切勿盲目进行按摩或使用药物，以免加重病情或产生副作用。如症状持续不缓解或加重，建议及时就医，以免延误治疗。