肛瘘的治疗以手术治疗为主，肛瘘挂线治疗也是手术治疗，对于肛瘘常采用的手术为肛瘘瘘管切除术和肛瘘切开挂线术，两种术式无所谓好坏，应根据病人肛瘘的类型来选择。肛瘘瘘管切除术适用于低位简单肛瘘，低位肛瘘瘘管不经过肛门括约肌，肛瘘切除时基本不损坏肛门外括约肌，从而不会引起肛门失禁等严重并发症。肛瘘切开挂线术适用于高位复杂肛瘘，术中能够准确找到肛瘘内口并进行处理，是彻底治疗肛瘘手术的关键，术后伤口引流通畅，愈合较快，但由于肛瘘切除后对肛门周围组织损伤较大，容易引起肛门变形、术侧疼痛，形成广泛的疤痕增生等，表现为肛门瘙痒不适。肛瘘挂线术是我国中医学发明的传统肛瘘手术治疗方法，经过不断改进，而形成的一种行之有效的治疗方法。