肾结石腰痛的原因，要了解结石产生腰痛的过程，结石产生腰痛必须有梗阻。所以对于肾脏下盏的小结石，比如5mm，甚至1cm的结石，不产生局部肾脏肾下盏的积水，理论上不会痛。疼痛可能是在某个时间段活动时，因为结石在肾脏里会到处跑，通常跑到最低的位置是肾脏下盏。但是如果某个时间跑到输尿管肾脏连接部的地方，也称为PUJ的地方，就是肾盂输尿管连接部的地方，这个位置是整个肾脏尿液的总出口。一旦总出口堵上之后，哪怕4mm结石、3mm结石，只要总出口堵住，引起肾脏积水增加，就会造成肾绞痛、腰痛的情况发生。