超声技术最早的应用是用于颅脑，之后由于种种原因，由于新生儿学科尚未发展，所以，在颅脑的应用受到限制。现在随着儿科医学和新生儿医学的发展，超声又回到扫查颅脑的领域。颅脑超声检查的人群有：临床怀疑有颅内病变和脑结构改变的新生儿、婴幼儿、早产儿、低体重儿、多胞胎、有异常分娩史的新生儿，还有母亲在孕期患有糖尿病、妊高症、出血、感染和保胎史等，都需要进行颅脑超声扫查。颅脑超声还可用于神经外科颅脑术中探查。