孕妇如果不幸查出患了肺结核，具体处理方法需按照孕期的早晚来选择，具体如下：1、早孕期：如果病情很轻，没有胸水，不影响呼吸，而且病灶很小，看起来比较稳定，此时可以等胚胎发育更大一点时再治疗。此外也可以选择流产以后再治疗，因为胚胎早期发育还不是很完全，流产对孕妇的影响也不是很大，如果病情比较重也建议进行流产。2、孕中晚期：结核药对于胎儿的发育影响不是很大，此时可以在怀孕的情况下给予标准化的治疗，同时辅以中医中药增强体质，以期对治疗的效果进行提高。3、孕晚期：一般抗结核药对胎儿的影响很小，所以此时也可以选择妊娠，同时给予抗结核药的治疗，而且要积极观察病情的变化，选择月份比较大的时候给孕妇进行引产，让胎儿早期离开母体，有利于产妇的治疗和恢复。综上所述，孕妇患结核后要根据不同的时期，采取不同的方式，根据病情的轻重来选择继续妊娠还是终止妊娠，同时也要考虑孕妇和家人的意见。