3个月幼儿频繁夜醒常见原因为消化不良、缺钙等，具体如下：1、消化不良：频繁喂奶易导致幼儿出现消化不良引起积食，出现腹胀、腹痛等腹部不适，引发幼儿频繁夜醒。3个月幼儿胃容量逐渐增大，喂奶量也逐渐增大，此时应将喂奶间隔适当延长，给幼儿一定的消化、吸收时间；2、缺钙：幼儿体内缺钙导致神经兴奋性增高，表现为明显烦躁、多汗、多动，甚至出现频繁夜醒。随幼儿身体逐渐长大，对钙剂、维生素D需求逐渐增加，应及时补充钙剂、维生素D。