附件囊肿是否会影响怀孕，具体情况如下：1、不会：绝大部分附件囊肿不会影响怀孕，比如黏液性囊肿、浆液性囊肿，以及卵巢局部单纯囊肿、输卵管系膜囊肿等，通常不会影响怀孕；2、会：部分附件囊肿对怀孕会造成影响，比如巧克力囊肿，不仅会引起进行性加重的痛经，还会导致不孕不育。所以对于附件区囊肿，如果有手术指征的情况下，可以考虑进行手术治疗。巧克力囊肿如果直径＞4cm，建议手术剔除治疗。如果其他病理性囊肿的直径＞5cm，可以考虑做手术治疗，否则随着囊肿增大、重量增加，可能会出现囊肿蒂扭转或囊肿破裂，造成急腹症的情况。如果是卵巢局部的囊肿，卵巢功能正常，仍然会周期性的分泌雌激素和孕激素，还会排卵，所以不会对怀孕造成相应影响，建议不要有顾虑。