男性患者排尿时尿道刺痛，应根据具体疾病选择治疗方式：1、尿道炎：如果男性出现尿道刺痛，可以进行尿常规检查，如果尿常规检查有白细胞，提示有尿道炎症，患者可以选用抗生素治疗，如头孢类、喹诺酮类、四环素类药物等，进行抗感染治疗；2、慢性前列腺炎：表现为尿道刺痛，伴有尿频、腹痛等症状，需要选择针对慢性前列腺炎的药物进行治疗，如α受体阻滞剂，松弛尿道、下腹部、盆腔紧张的肌肉，改善症状；3、单纯尿道刺痛：可以多饮水、多排尿，不要久坐，多运动。可应用对症的药物，如非甾体类消炎镇痛药、中成药等。经过检查诊断后，患者应在医生的指导下选择药物治疗。