早上嘴巴苦臭的原因有以下几种：1、食物：是否进食特殊、不易消化或有特殊味道的食物；2、药物：服用特殊药物造成口苦，需改良药物的进食方式，如用胶囊包裹或裹挟其他食物服用；3、口腔局部病变：特别注意牙齿、口腔黏膜及牙周完整性，有无感染、食物积滞；4、胃肠功能：特别是动力问题，有无反流、反流程度、造成的损害，是酸反流还是碱反流，需进行专业检查，包括食管测压、测酸及胃镜检查；5、全身状态：有无特殊的严重疾病，如慢性肾功能不全，需进行肝肾功能检查，以排除严重疾病对口腔感觉的影响。