CT的检查可以查出肠道疾病。腹腔中除小肠外，还有大肠，通常小肠疾病总的发病率较低，大肠由于参与消化、吸收，主要是储存大便的部位，实际发生结肠息肉、结肠肿瘤，包括消化道出血、炎症性疾病等的发病率要高于小肠。从发病率的角度来讲，如果认为出现肠道问题，检查应该以结肠镜为主。但是对于结肠的晚期疾病，或者肿瘤体积较大，进行CT检查也可以发现肿瘤，所以，CT也能够筛查大肠的中晚期疾病。如果肿瘤属于早期、体积不大，进行CT检查未必能够发现病变。另外，结肠镜只能检查大部分的结直肠以及小部分的回肠末段，大部分的小肠无法检查。通过病人症状或者现有检查，如果判断病人出现小肠的疾病可能性大，这时需进行CT检查，协助判断小肠是否存在疾病发生。