备孕期间应尽量避免做肠镜检查。肠镜检查需要较多准备，如需服导泻药物使肠道排空，导泻药物在身体代谢过程中，可能产生部分毒素影响胚胎发育。如果正处于备孕阶段，受精卵已经有可能在运输过程中未种植上，此时未到来月经的时间，无法确认是否停经或可能怀孕。肠镜检查可能为无痛检查，需进行静脉麻醉，均为对胚胎发育会产生影响的毒麻药物。如果需要做肠镜检查，建议明确没有怀孕，及月经期过后，在避孕情况下做肠镜检查。如果备孕期间已做胃肠镜检查，需经医生进行评估，对孩子是否存在影响。