引起牙周脓肿的原因较多，多由炎症所造成。常见的情况，比如牙周炎的患者，牙周炎没有得到及时治疗，在抵抗力下降时细菌毒性增加，在牙周袋内部出现牙周脓肿；另一种情况，比如镶完烤瓷牙，烤瓷牙边上的一些粘接剂没有完全去除干净，刺激到牙周组织，也有可能会发生牙周脓肿；一些患者是牙周与牙髓的联合病变，牙根与牙周组织中都有贯通性炎症。如果没有进行根管治疗，只是进行牙周治疗，或者两者都没有进行治疗，牙根里的细菌就会溢出到牙周组织，引起牙周组织脓肿；还有比如临床上较常见的智齿埋伏阻生，智齿长出了一点，它的周围会包着一圈牙肉，这些牙肉中很容易造成食物和菌斑的堆积，抵抗力下降的时候也会出现牙周脓肿；还有一部分患者是糖尿病患者并发牙周炎，这些患者他本身的抵抗力比较低，也会出现牙周脓肿。