早上起来出现肚子疼，考虑可能有以下几种疾病：1、胃相关疾病：最常见的是十二指肠溃疡，十二指肠溃疡的特点就是空腹时疼痛，晨起患者会出现胃痛，往往在吃过饭或者吃抑酸药，中和胃酸的药物之后，症状得到缓解。除此之外，有些患者胃酸分泌过多，仅是慢性胃炎，也有可能会出现早上起来肚子疼；2、肠道功能性疾病：有些患者有肠道功能紊乱，比如肠易激综合征，患者在晨起会出现脐周绞痛，随后出现大便习惯和大便性状的改变，可以出现腹泻、大便次数增多等，此时可以应用益生菌以及调节胃肠道动力的药物，进行综合治疗；3、胃肠道器质性病变：比如有胃肠道肿瘤，或者炎症性肠病，有可能会引起肠道梗阻，比如完全肠梗阻以及不完全肠梗阻，患者在早晨起来，有可能就会出现腹痛，同时伴有排便、排气不畅。