肾囊肿一般不会引起蛋白尿，如果肾囊肿的病人出现蛋白尿通常有以下几种原因：1、随着囊肿的长大，它有可能对肾脏造成挤压，导致部分肾脏功能丧失，除此之外挤压破坏了肾脏的正常形状，也容易导致局部形成肾结石，可能造成局部出现尿路感染，从而出现尿蛋白的增多；2、肾功能不全的病人，可能会出现尿蛋白增多。如果发现病人有尿蛋白增多，则要考虑是否有肾结石、尿路感染以及肾功能不全的情况，并针对原因进行相应的处理，缓解蛋白尿。可以通过肾功能检查，如血肌酐、尿素氮、血清胱抑素C、血β2-微球蛋白和血尿酸的水平等综合判断。如果出现肾功能不全，则要按照肾功能不全的治疗使用药物，除此之外如果肾囊肿较大，则要通过手术切除肾囊肿。