口腔里长水疱需根据其原因进行治疗，比较常见以下几种情况：1、黏液腺囊肿：发生在双颊黏膜、上下唇黏膜和舌尖腹部，有较多小的黏液腺，黏液腺导管堵塞后就形成黏液腺囊肿，需要到医院就诊，医生会用手术方法或激光方法，把已经破坏了的黏液腺取出；2、病毒感染：长小的水疱是病毒感染复发，特别常见在牙龈、牙龈黏膜部位，比如带状疱疹或者单纯疱疹病毒感染，都会形成牙龈起水疱，需要到口腔医院的黏膜科就诊，采用抗病毒治疗，才能有效的治疗病毒感染；3、天疱疮和类天疱疮：表现为大的亮水疱，需要到黏膜科就诊，进行免疫学检查，应该进行天疱疮、类天疱疮抗体的血清学检查，或者切取一块疱壁做直接免疫荧光，或者间接免疫荧光的检查确诊。所以口里起疱的情况比较复杂，最常见的就是黏液腺囊肿，可能是病毒感染引起，比如单纯疱疹病毒和带状疱疹病毒引起的嘴里单纯疱疹感染，或者带状疱疹感染，还有大疱性疾病在口腔的表现，如天疱疮或类天疱疮，都需要到医院就诊，在医生的指导下用手术或者用药物治疗。