儿童的泌尿道感染应采取其它措施，因为儿童泌尿道感染在整个尿路感染中，有其特殊性。首先要除外儿童有没有先天性异常，解剖异常，包括儿童常见的巨结肠症、巨输尿管症引起的尿路梗阻。因此其在使用药物时要复杂些，多数药物不适合于儿童。比如治疗急性膀胱尿道炎常用的喹诺酮类药物，不适合儿童，因为其会影响骨骼系统的发育，18岁以下的年龄段，特别是界定儿童14岁以下更不能用此类药物。包括左氧氟沙星和环丙沙星，这些药物不能用在儿童。部分对儿童肝肾功能发育有影响的药物，比如氨基糖甙类、链霉素、庆大霉素，可引起肾功能损害，部分药物还会引起听神经损害、神经性耳聋，所以这类药物对儿童也不能使用。