小儿便秘就诊的科室，需要具体根据引起便秘的原因，具体如下：1、小儿外科：刚出生或小月龄孩子出现较严重便秘时，可能要警惕孩子存在消化道结构异常，最好去小儿外科就诊，因为消化道的结构异常，可能需要外科干预，但相对少见；2、小儿消化内科：如果年龄稍大的孩子，尤其是刚添加辅食，或从母乳向奶粉过渡过程中的孩子出现便秘，此时考虑为功能性便秘，属于消化系统的疾病。如果去儿童专科医院就诊，科室设置相对比较细致，如果有小儿消化内科，可以带孩子去小儿消化内科就诊，相对最为合理；3、小儿内科或儿科：部分综合医院对儿科设置没有明确分组，或者科室设置不严格或细致，可能只有综合内科或只有儿科，此时需要去小儿内科或儿科就诊。因此孩子发生便秘时，要确认引起便秘的诱因，一般可以结合孩子的年纪和相关表现确认，再去相应科室就诊。