医生不建议进行核磁共振检查的原因可能有以下几种：
1. 幽闭恐惧症：患有幽闭恐惧症的患者不建议做核磁共振，因为他们进入比较封闭的环境会出现异于常人的表现，如紧张、恐惧、濒死感等，而做核磁共振正是需要进入这种环境内完成的，患者很可能会出现身体不适，所以医生会不建议此类人群做核磁共振。
2. 孕妇：特别是在怀孕的前三个月的时期，不建议做核磁共振，因为这个时期是胎儿生长发育的关键时期，而做核磁共振的过程中，会产生很多噪音和能量，可能影响到胎儿的生长发育。
3. 携带金属制品：如体内装有心脏起搏器、口腔金属牙套、身体骨折处钢板等金属制品的患者不建议做核磁共振，因为核磁共振机器有强大的磁场，可能会干扰心脏起搏器的正常工作，或者金属制品会影响核磁共振的成像，导致成像质量下降，影响对疾病的判断。
4. 检查部位：核磁共振的成像原理主要是利用磁场引起体内水分子位置的改变而进行分析观察，有些部位的含水量较少、气体较多，亦或是存在不停的搏动，如胃部、心脏等，无法清晰的成像，可能会影响对疾病的判断，所以医生会不推荐做核磁共振。
5. 价格原因：由于核磁共振的价格是根据部位进行收费的，价格会相对较高，对于没有必要进行核磁共振检查的患者，医生可能会出于经济原因不建议其进行此项检查。
总的来说，医生根据患者的实际情况和检查需求，会针对个别案例不建议进行核磁共振检查。
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