通常吃进去的益生菌自身在肠道内繁殖生长需要一定时间，一般如果有轻度菌群失调情况，可能吃肠道益生菌2-4周即可。但如果有严重菌群失调情况，如菌群失调是因应用抗生素所致，在补充益生菌的同时还在应用抗生素，边补充边破坏的情况下益生菌使用时间更长，通常可能需要3-6个月。 益生菌是对人体非常有益的一类微生物，吃益生菌的目的主要是为帮助肠道内失调的菌群重新建立起正常平衡状态。人体内含细菌菌量非常大，所以要想完全靠吃进去的益生菌达到肠道内正常菌群的建立不现实也不可能。 吃的益生菌药物菌种比较单一，一般只含有一种，最多含有3-4种。所以要想让所有益生菌都能够达到平衡状态，可能还要序贯补充多种益生菌，这样才能起到很好的效果。