右侧附件区囊肿是否严重，主要看囊肿的性质，具体如下：1、不严重：生理性囊肿并不严重，如黄体囊肿，在临床上一般没有症状，通过B超检查才会发现，建议在月经后再复查，绝大部分囊肿会明显缩小，甚至会消失，不用特殊处理；2、严重：病理性囊肿就比较严重，比如巧克力囊肿，直径＞4cm的情况下建议考虑手术治疗。如果是其他病理性囊肿，直径＞5cm也要考虑给予手术治疗。此外，如果右侧附件区囊肿是由于卵泡黄素化所致，这种情况在临床通常会导致排卵功能障碍，会引起不孕不育，建议肌肉注射绒毛膜促性腺激素治疗促进排卵。在药物治疗效果不好的情况下，也可以考虑在B超指示下做局部穿刺来协助排卵，这样也会使临床达到怀孕的目的。因此，右侧附件区囊肿究竟严不严重，主要看导致囊肿的原因，根据病因再决定是否需要临床处理。