肾囊肿一般是由膨大的肾小管导致的，肾小管进一步膨大以后，就会导致肾囊肿，导致肾囊肿的原因：1、遗传：常见的就是遗传，肾囊肿虽然不是一种明确的遗传性疾病，但是和遗传还是有一定关系，特别是多囊肾的病人，和遗传有明确关系；2、肾小管的畸形：病人会有一些肾小管的畸形，这种畸形的肾小管容易导致肾小管的憩室，肾小管的憩室进一步膨大以后，就会导致肾囊肿的发生；3、感染、肾结石、肾结晶：病人可能合并感染，或者肾结石、肾结晶等，这种感染或者肾结石、肾结晶，对于肾小管也有一定影响，这个时候病人也可能会出现肾小管膨大以后，导致肾囊肿的发生；4、细胞因子：表皮上生长因子或者胰岛素样生长因子比较高的时候，这个时候病人肾囊肿的形成和肾囊肿长大的速度可能都比较快。