三清茶通常不能治疗幽门螺杆菌，目前权威机构中华医学会幽门螺杆菌学组所发布的治疗幽门螺杆菌的治疗方案是四联方案，大致有7种不同的组合，包含的治疗药物有质子泵抑制剂，以及铋剂和两种抗菌素。这类四联的药物在各自发挥各自的作用以后，产生综合抗体幽门螺杆菌的效果。幽门螺杆菌本身是致病菌，也具有传染性，而且有较强的增殖能力和致病力，治疗这类细菌仅喝三清茶并不可能治愈。三清茶不是治疗药物，所以没有治疗幽门螺杆菌感染的功效。如果确定存在幽门螺杆菌感染，应规范进行治疗，即选择权威机构推荐的治疗方案进行规范治疗。三清茶无论在从宣传上显示有何种功效，若不是国家药监局批准的药品，就不能用于治疗疾病。