胆总管囊肿手术是要在全身麻醉下来进行胆总管囊肿切除以及胆管、小肠的重新吻合。对于这样的手术，需要考虑以下方面的因素。首先是病人一般的身体状况，包括心脏、呼吸系统、肝肾功能，全麻手术对于身体的多个系统都会产生影响，手术过程本身难度以及风险是要取决于囊肿大小、是否出现合并症，甚至是包括癌变的可能。由于囊肿有的比较大、炎症、粘连或者是侵犯了肝内甚至到胰腺内部。在手术过程当中有可能会出现大量的出血、血管损伤、胰腺损伤、肝脏受损以及手术后出现胆肠吻合口瘘、胰腺瘘、胃肠功能排空障碍、继发腹腔感染以及伤口并发症等。所以胆总管囊肿是属于相对比较复杂，而且是存在一定风险的手术。