如果在同房的时候发生右侧小腹部疼痛，具体原因如下：1、囊肿：如果通过常规体检发现有右侧囊肿或者输卵管囊肿，由于同房时的碰触，导致囊肿发生了扭转或者破裂，引起右侧下腹部疼痛； 2、子宫内膜异位症：患者需要留意平时是否有痛经，如果有痛经，有可能有盆腔子宫内膜异位症，从而引起疼痛； 3、深部性交痛：在同房尤其是深部性交时，有些女性会有深部性交痛，由于同房时碰触到盆腔深部内膜异位病灶，就会产生深部性交痛； 4、炎症：如果有些女性有盆腔炎或者阑尾炎等炎症，在同房时可能会刺激到炎症部位，从而引发疼痛； 所以如果同房时发生了右小腹疼痛，仅仅是疼痛且持续时间不长，后来自行缓解，可以不进行特殊处理。如果出现了持续性腹痛，患者需要及时就诊，以排除是否有卵巢囊肿破裂或者卵巢扭转，这些疾病属于急腹症，需要及时处理，甚至需要及时手术。