如果人们睡觉时肚子疼，医学称为睡眠时腹痛，可能原因主要包括以下几种：一、生理性原因：1、受凉：可能为人们睡眠时受凉，部分人们肠管较敏感、易激惹，受凉时肠管感受到低温，可能会出现肠管收缩引起腹痛症状；2、膀胱储尿较多：可能人们睡眠时憋尿，如果膀胱内积存大量尿液，可能也会引起腹痛症状。二、病理性原因：1、自主神经功能紊乱：可能为肠管或者腹腔内病变，人们平时没有睡眠时由于注意力被转移，比如工作或者做其他事情时，注意力没有关注到病变部位，但睡眠时可能注意力会关注到病变部位，会出现腹痛症状。可能为功能性疾病称为自主神经功能紊乱，一般会引起肠功能紊乱，人们会出现腹胀、间歇性腹痛症状；2、肠道器质性疾病：可能原因为肠道存在炎症、肿瘤，常见比如小肠克罗恩病、肠结核，其他非特异性肠炎、结肠肿瘤、炎症等情况，均可能会引起患者出现腹痛症状。