卵巢囊肿5cm怀孕了会不会发生病变，可能性主要是根据卵巢囊肿的性质来判断。卵巢囊肿5cm要进一步通过B超、CT、核磁判断卵巢囊肿内容物，比如是不是全部液体成分、有没有组织性东西、有没有乳头、有没有血流，以及肿瘤标记怎么样、活不活动、有没有黏连与扭转，帮助判断有没有发生病变的可能性。如果一切正常，内容物只是水，肿瘤标记等都没问题，发生病变的可能性不大，但如果本身就已经是实性，内容物有乳头、有血流等，肿瘤标记都很高，则要小心。所以不能一概而论，要根据情况来定。但很多卵巢囊肿，尤其是怀孕早期的部分囊肿是黄体或黄素化囊肿，实际上不需要特别处理，随着孕期的进展，可能会缩小甚至消失。所以这部分囊肿大多数不需要手术处理，只需要定期观察、定期随访，看变化再决定需不需要处理或开刀。所以卵巢囊肿和怀孕的关系非常密切，大夫和患者一定要密切观察，根据不同情况作出不同处理。