甲胎蛋白和癌胚抗原是不相同的两个指标，具体如下：1、甲胎蛋白：也叫AFP，其异常表达可能与体内肝癌的发生有一定相关性，也有部分肿瘤可能提示甲胎蛋白与生殖源性肿瘤有一定相关性，但是并不绝对；2、癌胚抗原：也叫CEA，也是作为血清学肿瘤标志物中常见指标，这个指标升高，不像甲胎蛋白具有相对高的特异性，其特异性相对要差，多数可以见于消化系统肿瘤，比如肝癌、胆道癌、胰腺癌、胃癌、肠癌，可能都会导致该指标的异常表达。除此以外，比如肺部肿瘤或者女性的乳腺癌、妇科肿瘤等，可能也会影响到该指标的表达，因此其特异性欠佳。甲胎蛋白和癌胚抗原同为血清学肿瘤标志物，在诊断上可以作为辅助或者补充的功能，无论这个指标表达的情况高低与否、正常与否，最主要的还是要结合影像学的评估，包括CT或者镜检的检查，来判断体内是否有肿瘤存在。一旦发现了肿瘤，早期肿瘤应及早给予根治性治疗，改善病人预后。