部分睾丸肿瘤患者的甲胎蛋白会有所升高，升高数值因病人、病情而异，并不是所有的睾丸肿瘤患者甲胎蛋白都会升高。常见的睾丸肿瘤分为几种亚型，如精原细胞瘤，甲胎蛋白不会升高，另外非精原细胞瘤里的胚胎癌，多数患者会有甲胎蛋白升高。甲胎蛋白升高，可作为睾丸肿瘤的瘤标之一进行病情判断，以帮助早期发现睾丸肿瘤的存在，还可以依靠甲胎蛋白数量的高低进行肿瘤分期。另外术后可通过监测甲胎蛋白，来监测肿瘤复发或转移。如果术前甲胎蛋白升高，做完睾丸根治性切除手术后，甲胎蛋白回落到正常值内。经过一段时间随访，发现甲胎蛋白再次升高，多数提示肿瘤复发和转移的可能。