在脊膜膨出进行手术以后，大部分的患者可能会有一个比较好的治疗效果。但是根据手术的时机，还有脊膜膨出的炎症程度，可能也会留有一定的后遗症，具体后遗症有以下几点：1、如果一部分脊膜膨出手术时机相对选择偏晚，病人因为年龄偏大，同时合并有其他的畸形，这些畸形会作为后遗症遗落下来。比如有些脊膜膨出的患儿，可能会出现脊柱发育的畸形，出现脊柱侧弯，有些甚至可以出现双下肢的长度不等，即使做了手术以后，仍然无法得到很好的纠正，就是一种后遗症；2、有些患儿因为在手术的过程当中，发现脂肪瘤或者病灶组织，和神经的粘连过于紧密，术前神经已经受到膨出压迫，发生了变性。此时即使经过后期的手术，也可能会出现膀胱机能不全，还有肠道功能不全的后遗症。表现为压力性膀胱、膀胱过于庞大，每次接小便的量很少，但是在膀胱里蓄积的尿液却很多。也有部分就是表现为肠道的扩大，表现为巨结肠、便秘。也有一部分表现为腹泻等，都是比较常见的手术后的后遗症。