治疗脑血栓的药物有很多种，需要长期使用，常见的有：1、抗血小板或抗凝药物：抗血小板药物如阿司匹林、氯吡格雷、替格瑞洛或西洛他唑等；某些脑栓塞所致的脑血管意外，可能来自于房颤，随着心房栓子脱落导致的则需此类药物治疗，经典药物有华法林，口服的第二代抗凝药有利伐沙班、达比加群；2、降脂药：选用合适自己情况的他汀类药物，把低密度脂蛋白降到1.8mmol/L以下，或原来水平的50%以下；3、其他药物：伴有高血压病、糖尿病、高同型半胱氨酸血症的患者需相应控制血压、控制血糖，或使用叶酸、甲钴胺和维生素B6进行联合治疗。