一般肾囊肿微创手术有两种手术方式，不同方式所需时间不同，具体时间如下：1、1个小时左右：经腹腔镜下的囊肿去顶术通常需要在全麻下进行，通过腹腔镜伸进镜子找到肾囊肿后，将囊肿顶部的囊肿壁彻底剪开，使得囊肿完全暴露，可减少未来囊肿复发的机会。此种手术因为需要全麻，所以总体的手术时间取决于囊肿的大小以及囊肿的部位，通常手术的整个过程是在1个小时左右；2、10-20分钟：肾囊肿穿刺引流加硬化剂注射是一种微创治疗方法，要在局麻下进行。可以在B超引导下从腰部穿进一根针，一直穿到肾囊肿里面将囊液抽吸，同时往肾囊肿内注射药物使肾囊肿内组织发生变性坏死，最终使囊肿的两层囊肿壁粘在一起，可以达到远期不复发。相对比较简单，一般手术时间是在10-20分钟，但有些患者在治疗之后存在囊肿复发的可能。