肺结核可以通过痰涂片、培养鉴定。现在CT、功能磁共振、X光，也具有诊断价值。 现在还有分子生物学可以判断细菌到底是结核还是非结核分枝杆菌，还是其它细菌，从分子水平进行鉴定。 许多基层医院仅能做抗酸染色，抗酸染色是阳性，多数情况下就是结核杆菌，但是抗酸染色阳性，也可能是非结核分枝杆菌，也可是麻风分枝杆菌、诺卡放线菌、枯草杆菌、军团菌。 所以抗酸染色阳性只是初步诊断，要确诊是否是结核，还要进一步做更多的实验室诊断。也可以在有经验的临床医生结合胸片、发烧、咳嗽、盗汗、消瘦做初步诊断。