肛周脓肿和肛瘘是同一个疾病的不同发展阶段，不能简单地认为哪个更严重。具体如下：1、肛周脓肿：是急性期肛门周围感染，这个时间肛门周围局部红、肿、热、痛比较严重。此时期肛门周围组织的化脓性感染，随着脓液越来越多，脓腔的压力越来越大，疼痛越来越剧烈，发展比较迅速，伴有全身发热的症状；2、肛瘘：一旦脓肿破溃后，就称为肛瘘。肛瘘可以表现为慢性期，主要是同一位置反复发作的感染，疼痛、流脓，脓液顺着瘘管排出至肛门外。无论是肛周脓肿，还是肛瘘，都需要手术才能治愈，手术是治疗的重要办法。