同房后小肚子痛的原因主要包括以下几点：1、子宫内膜异位症：通过查体发现阴道后穹窿部位有触痛结节，属于子宫内膜异位症的特异表现，结节在同房时如果被触碰，则会引起明显的性交痛。确诊后有时需要手术治疗将病灶切除，有时可先给予药物治疗，如米非司酮、短效口服避孕药，通过这些药物的治疗能够有所缓解；2、盆腔炎：需要通过妇科检查和B超检查明确，如果妇科检查发现子宫压痛、附件区增厚压痛，则属于盆腔炎的特异体征。B超检查可能并没有特殊表现，但有时会伴有盆腔积液。患有盆腔炎的女性在同房时，如果触碰宫颈部位，则会引起子宫的摆动，从而导致性交痛。此时可给予抗生素进行抗感染治疗，通常还需要结合活血化瘀类的中药。