喉咙吞咽时一侧有针扎感，可能由于茎突过长、胃食管反流、急性咽喉炎导致，具体如下：1、茎突过长：茎突位于咽喉两侧，如果茎突大于3cm，可以刺激周围肌肉组织出现疼痛，尤其在吞咽时感到一侧疼痛；2、胃食管反流：胃酸可以刺激咽喉部黏膜出现慢性炎症，吞咽时可感到一侧或两侧黏膜出现疼痛；3、急性咽喉炎：由于抵抗力下降，细菌或病毒侵袭到上呼吸道，出现喉咙急性炎症感染，检查时可发现咽腔黏膜充血。如果合并急性扁桃体炎，还可发现双侧扁桃体水肿、表面存在脓液，甚至伴有发热等全身症状。