小腿骨头疼痛可由以下原因引起：1、生长痛：常见于儿童时期，如果生长较快或者缺钙，多可出现生长痛，好发于小骨、胫骨，给予观察、理疗即可，症状可以逐渐缓解，儿童要适当补充钙剂；2、外伤：外力直接作用或者间接传导，导致骨软组织损伤，患者出现疼痛，患者多有明确外伤史，需要进行X线、CT检查；3、腰椎间盘突出：刺激坐骨神经，导致坐骨神经支配区域出现疼痛、麻木症状，需要进行腰椎CT检查、核磁共振检查明确诊断；4、局部病变：发生于胫腓骨的骨病变或者发生于肌肉的软组织病变，可导致小腿骨头出现疼痛，需要行CT检查、核磁共振检查和病理活检明确诊断。