早晨起床后腰疼但是活动后就好了，可能是以下原因导致的：

1. 腰部受凉：睡觉时腰部受凉（如吹空调或冬季受寒等），导致腰部肌肉僵硬板直，局部血液循环不畅，从而引起腰部疼痛。起床活动后，局部血液循环得到改善，疼痛症状得以缓解。
2. 腰肌劳损：由于睡觉时机体长时间处于一个姿势，或者姿势不正确，造成肌肉长时间处于张力状态，导致肌肉劳损。起床活动后，肌肉劳损得到缓解，疼痛症状就减轻了。
3. 床垫不合适：床垫过软或过硬，睡觉时无法维持脊柱的生理曲线，腰部肌肉得不到放松，从而导致腰疼。更换合适的床垫后，疼痛症状通常会得到缓解。
4. 腰椎小关节紊乱：腰部活动时，小关节的活动范围较大，容易发生微小的错位或水肿。起床活动后，小关节恢复正常位置，水肿减轻，疼痛症状就减轻了。
5. 腰部肌肉力量不足：腰部肌肉力量不足，无法支撑脊柱和上肢的重量，导致腰疼。通过适当的锻炼和按摩等方法，可以增强腰部肌肉的力量，缓解疼痛症状。

如果以上方法不能缓解腰疼症状，建议及时就医，排除其他潜在的疾病。平时要注意保持正确的睡觉姿势和坐姿，避免长时间久坐和过度劳累。