早发动脉粥样硬化的患者中发现血浆高密度脂蛋白胆固醇水平降低存在脂蛋白脂酶基因（Asn291→Ser）突变。对荷兰17个FCHL家系的筛查证实该突变与血浆极低密度脂蛋白升高相关，但并不影响血浆LDL胆固醇浓度，说明该突变可能是FCHL的遗传易感位点之一。研究发现基因和环境间的相互作用与脂蛋白脂酶基因的异常表达有关。有脂蛋白脂酶缺陷的杂合子患者仅能解释FCHL患者的10%。但Babirak等研究发现36%的FCHL患者有低水平的脂蛋白脂酶活性。回归分析显示载脂蛋白B、载脂蛋白CⅢ和脂蛋白脂酶基因的突变与血浆甘油三酯、高密度脂蛋白胆固醇、载脂蛋白A1和载脂蛋白B呈有意义的相关，这些侯选基因编码蛋白区域的变异可影响脂蛋白代谢和脂蛋白水平。

　　55个家系的复合分离分析暗示有一个主基因明显地影响FCHL患者的血浆甘油三酯水平，遗传可解释FCHL血浆甘油三酯水平变异的20%。Hayase研究认为高密度脂蛋白胆固醇和载脂蛋白AI的遗传度分别是0.43和0.66。Hamsten及其同事的家族研究认为遗传因素可影响血浆甘油三酯浓度变异的33%，环境因素如吸烟、饮酒、肥胖可影响23%，提示遗传是主要的决定因素，该研究结果暗示3个家族中几乎一半是由遗传因素导致血浆甘油三酯浓度的变异。

　　遗传学的连锁研究目前还没有最终确定FCHL的易感基因。Wojciechowski家系的连锁分析显示载脂蛋白AⅠ-CⅢ-AⅣ基因簇的变异是导致FCHL的一个易感区域（LOD SCORE=6.86），但存在很大争议。即便如此该基因簇仍在脂蛋白的调节中发挥较大作用。在多个不同人群研究中证实该基因簇DNA片段的变异导致严重的血脂异常，参与血脂的转运和代谢。调整了年龄、性别、身体肥胖指数后，血浆载脂蛋白AI，载脂蛋白B、高密度脂蛋白胆固醇、甘油三酯及总胆固醇与载脂蛋白AⅠ-CⅢ-AⅣ基因簇多态性位点相关。该区域可能是动脉粥样硬化最重要的遗传决定因子。

　　人类基因组计划建立的5 000多个遗传标记为利用基因组扫描技术研究遗传标记与数量性状的关系提供了可能，大规模的家系研究是寻找其它侯选基因和未知遗传易感位点的有效研究方法。在我国，临床医生、流行病学家及遗传学家的积极合作是收集家系进行基因定位克隆的最佳途径。

　　认知FCHL已有许多年，但是当面对高脂血症时，仅有少数内科医生考虑本病，因此告知内科医生FCHL是一种明显的遗传病是非常重要的，对怀疑有FCHL的患者应当进行家族血脂测定，并筛查是否有。