跑步后膝盖疼痛的最主要的原因，可能包括软骨的损伤、半月板的损伤和滑膜炎症、髌骨半脱位，具体分析如下：1、软骨的损伤：跑步后软骨的损伤，通常是因为长期不运动，出现局部压力反复短期内剧烈增加，会引起膝关节、胫骨或股骨的软骨下骨，出现挫伤。此时拍核磁共振会看到软骨下骨的骨水肿，通常是平时活动少，突然做剧烈运动，或者在水泥地、公路上跑步，由于地面过硬所导致；2、半月板损伤：主要是跑步过程中出现扭伤，导致半月板出现损害，或者是本身存在半月板的退变，半月板不明显撕裂，然后跑步时候出现加重；3、滑膜炎症：因为本身如果有痛风、风湿、类风湿性的关节炎，或者是免疫的紊乱，容易在跑步后出现滑膜炎，主要表现为关节肿胀、全关节酸痛；4、髌骨半脱位：如果跑步加了坡度，或者是起伏路面跑步，容易出现髌骨关节的疼痛。这种情况通常是因为髌骨半脱位真的存在，加坡度的时候，会出现髌骨关节的磨损，会造成膝盖前方的疼痛。所以跑步后膝盖疼痛，实际上还是比较复杂的，主要包括这4方面的原因。需要仔细分析，最好是找专业的医生查看。