肛门直肠的坠胀、疼痛原因很多。肛门直肠部位病变，如溃疡、脓肿、异物，另外肛窦炎等炎症也是肛门直肠坠痛的常见原因。这些原因有的跟排便有关系，有的跟排便没有关系，但很少造成半夜突然坠痛、从睡梦中醒来的情况。 特发性肛门直肠疼痛，原因不清楚，也找不到具体病变。在临床上经常有一些病人突然出现肛门直肠的痉挛性剧烈疼痛，持续时间在2-3分钟之内，疼痛缓解后无其它异常。目前该病尚无有效治疗方法。 现在发现特发性肛门直肠疼痛可能与精神或情绪等因素有关，推测可能是精神类疾病的躯体化症状之一，因一过性的神经功能障碍造成疼痛。但其确切原因还在探索之中。