急性上呼吸道感染最常见的病原体有以下几个方面：1、病毒感染：常见于鼻病毒、呼吸道合胞病毒等病原体感染。病原体感染，尤其是病毒感染，潜伏期主要是1-3天，这类病人会出现鼻塞、流涕、打喷嚏、流眼泪等卡他症状，同时可能伴有咽痛、咳嗽等呼吸道症状，病人可能同时伴有发热，这是急性上呼吸道感染发生病毒感染常见的症状；2、细菌感染：以革兰氏阳性球菌感染为主，包括卡他莫拉氏菌、流感嗜血杆菌等，部分上呼吸道感染是由于非典型致病菌感染所引起，如支原体、衣原体感染等也是上呼吸道感染常见的病原体。上呼吸道感染最常见的病原学感染是以病毒作为主要的病原体感染方式，但其他病原体在相关检查中也可以发现，比如细菌感染的时候，白细胞分类和白细胞总数会明显增高。非典型致病菌，如支原体、衣原体感染，可以做支原体抗体检查确定。因此要根据不同的病原学特点，进行急性上呼吸道感染的治疗。