急性上呼吸道感染的常见病原体如下：1、病毒：包括鼻病毒、EB病毒、疱疹病毒、柯萨奇病毒、呼吸道合胞病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、流感病毒、副流感病毒等。上述病毒可以引起病毒性鼻咽炎、急性喉炎、急性咽峡炎及疱疹性咽峡炎，当病毒感染3-4天后，细菌可能会侵入呼吸道而合并细菌感染；2、细菌：比如链球菌，感染后可以引起急性扁桃体炎、化脓性扁桃体炎、细菌性扁桃体炎。当合并细菌感染时，患者会表现为高热、咳嗽、有痰，检查血常规会发现白细胞及中性粒细胞增高。若患者出现双侧扁桃体增大的症状，可以加用抗生素进行治疗；3、非典型病原体：包括支原体及衣原体。