水土不服腹泻往往是功能性腹泻，并不是感染引起，不必吃抗生素，可以吃调节肠道菌群的药物，如培菲康(双歧杆菌三联活菌散)、整肠生(地衣芽孢杆菌活菌胶囊)，里面含有乳酸杆菌、双歧杆菌、地衣芽孢杆菌等，对于腹泻，尤其是水土不服等功能性腹泻有很好的疗效。还可以吃思密达(蒙脱石散)，也有很好的疗效。还可以吃中成药，如常用的葛根芩连丸、健脾益气的参苓白术丸，也有一定疗效。夏天可以吃藿香正气丸、藿香正气胶囊，或香砂和胃丸，有一定的健脾化湿作用。