两侧肾区出现隐隐作痛的原因，需要区分肾区不同的组织和器官的病变，例如皮肤、腰肌、腰椎以及肾脏或者输尿管，分析如下：1、如果是皮肤出现病变，最常见的就是外伤、蚊虫叮咬或者带状疱疹等可以引起隐隐作痛，而且带状疱疹引起的疼痛是非常严重的，很多人无法忍受，持续时间比较长，从外观上可以进行鉴别诊断；2、腰肌出现外伤、炎症以及腰肌劳损可以出现疼痛，特别是腰肌劳损发病率比较高，在活动后可以加重或者减轻；3、腰椎的异常包括椎间盘突出和骨质增生等，也包括外伤，根据外伤的病史以及腰椎的X光片，或者腰椎CT，进行详细的鉴别诊断，在弯腰或者提重物的时候可能加重，提示是椎间盘突出；4、如果排除皮肤、腰肌以及腰椎的问题，可能是肾脏出现异常，造成肾脏的疼痛的病变常常是炎症、结石、积水、出血或者肿瘤变位，需要进一步做影像学来进行鉴别诊断。如果进行结石和感染，治疗可以使这种疼痛消失，而肿瘤和结石以及出血或者积水，必须泌尿外科来进行积极的治疗，才能使疼痛得到很好的治疗。