孩子阴茎疼痛的原因具体如下：1、包皮龟头炎或阴茎体炎：孩子阴茎疼痛一般都是包皮龟头炎，或者阴茎体炎，出现这种情况以后，孩子阴茎体肿胀、包皮肿胀，会有水泡、红肿，或者有脓性和黏性分泌物，出现这种情况以后，一定要让孩子多喝水、多排尿，可以买红霉素眼膏均匀涂抹在孩子的阴茎体、包皮口，以及尿道口周围，会起到非常好的治疗作用，一般经过1-2天的治疗即可痊愈；2、包皮过长或包茎：如果孩子经常出现这种情况，也可以看孩子的包皮是不是过长，有没有包茎情况，看最近孩子是不是活动量比较大，饮水量比较少，出汗多，孩子排尿少，在这种各种原因影响下造成局部感染。如果孩子已经到了学龄后，或者青春期，这个时候如果孩子经常出现局部感染，也可以考虑将孩子包皮过长的状态，或者包茎，做包皮环切手术，将孩子多余的包皮切除掉，切除掉以后孩子龟头外露，此时保持局部干燥，同时平时护理也更方便，方便局部的清洁护理，不给细菌滋生的环境和机会。