植物神经紊乱的特效药是主要调整植物神经平衡的药物，比较常用的药物是谷维素，谷维素本身是可以调整植物神经，所以以前比较常用。对比较轻的植物神经紊乱，可以用谷维素来调整，还要用营养神经的药物，因为植物神经紊乱也是因为神经不稳定造成的，可以用维生素B1、维生素B12补充，在治疗后，可以改善植物神经紊乱。现在对比较严重的植物神经紊乱，需要给予调整焦虑、抑郁症状的药物，最常用、现在比较新型且副作用相对较小的药物是5-羟色胺再摄取抑制剂，可以改善或治疗各种各样的植物神经紊乱。部分植物神经紊乱是躯体化障碍为主的患者，常用的药物是西酞普兰，可以改善躯体形式障碍，包括肚子痛、胸闷等症状。